在第二部，故事发生在钢铁天使1的29年后，钢铁天使的主人死后把钢铁天使藏在佛像中...高中女学生那一天去神社的地窖放东西时无意中再次唤醒了沉睡中的钢铁天使久留美，此后钢铁天使久留美的两个姐妹都用不同的方式醒了过来，后来的故事姐妹们又由敌人变成了姐妹......

伊吹コウジはヴァンガードファイター！立凪邸に呼び出された伊吹は、なんとifの世界に飛ばされてしまいました！ifの世界は歴史が歪み、カードファイトが通用しない世界！？伊吹は、ifの世界で不思議な美少女コンビに出会います。それが、魔法少女・先導エミ！カードの妖精・シュカ！２人はカードからユニットを召喚して、悪の手先ジャマーと戦うブラスター・ペア！伊吹、エミ、シュカ、そして巻き込まれてしまっ...

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主人公铃原 美咲（みさき）为就读初中投奔居住在东京的阿姨.刚刚抵达东京的美咲被车站大荧屏上的机械天使对战所吸引.在一位穿着白大褂的男子怂恿下购买了一枚机械天使的卵.之后美咲从这个天使之卵开始培育出了属于自己天使 小光（ヒカル）.并与小光一起开始了天使领域的对战,在这期间她结识了新的朋友,也不断超越着过去自己,最终在天使领域全国上取得了优胜....

STORY故事背景開始在西元 2029年，地中海沿岸的地基忽然間下沉，導致了氧氣忽然間消失，而自此之後原本存在的各種元素也陸續的消失。由於自然界中的各種元素不復存在，因此無論是建築物、森林、動物等各種生命也逐一的消失了，此時的人類也才深深的感受到這些「元素」的重要性。在那之後又經過了 60 年，人口也減至為十分之一，而根據調查的結果，發現消失的元素都流向了次元另一側的另一個地球「ネガアース」。...